Cục Hải quan vừa chính thức công bố triển khai Thông tư 29/2025/TT-BTC do Bộ Tài chính ban hành, quy định về thu thuế giá trị gia tăng (VAT) tự động đối với hàng hóa giá trị thấp nhập khẩu qua dịch vụ chuyển phát nhanh. Thông tư có hiệu lực từ ngày 9/7/2025, với lộ trình áp dụng toàn diện bắt đầu từ ngày 1/8/2025.
Theo đó, cơ quan hải quan sẽ thu VAT tự động đối với tất cả các lô hàng nhập khẩu dưới 1 triệu đồng thông qua các doanh nghiệp chuyển phát nhanh, không phân biệt phương thức vận chuyển (đường bộ, hàng không hay đường sắt).
Động thái này được xem là bước điều chỉnh chính sách thuế sau khi quy định miễn thuế VAT đối với hàng hóa giá trị nhỏ bị bãi bỏ từ ngày 18/2/2025, theo Quyết định số 01/2025/QĐ-TTg. Tuy vẫn tiếp tục miễn thuế nhập khẩu, nhưng kể từ thời điểm đó, nhóm hàng hóa này đã phải chịu thuế VAT.
Trước khi Thông tư 29 có hiệu lực, việc thu VAT đối với hàng hóa giá trị thấp chủ yếu được thực hiện thủ công, do hệ thống hải quan chưa cập nhật kịp thời. Cách làm này không chỉ làm tăng chi phí xử lý mà còn gây ùn tắc trong khâu khai báo và nộp thuế, đặc biệt khi số lượng đơn hàng nhỏ tăng mạnh.

Theo thống kê, mỗi ngày có khoảng 4–5 triệu đơn hàng từ Trung Quốc được vận chuyển về Việt Nam qua các sàn thương mại điện tử, phần lớn có giá trị dưới 1 triệu đồng – tức thuộc diện chịu VAT theo quy định mới.
Bộ Tài chính kỳ vọng, với thuế suất 10%, nguồn thu ngân sách từ nhóm hàng này có thể tăng thêm khoảng 2.700 tỷ đồng/năm, góp phần mở rộng cơ sở thuế và tăng cường minh bạch trong thương mại xuyên biên giới.
Để đảm bảo tính khả thi, quy trình thu thuế tự động sẽ được thí điểm từ ngày 9 đến 31/7/2025 với một số doanh nghiệp chuyển phát nhanh lớn. Sau đó, từ 1/8, toàn bộ các doanh nghiệp cung cấp dịch vụ chuyển phát nhanh sẽ phải áp dụng quy trình mới, bao gồm tích hợp hệ thống khai báo điện tử, xác định trị giá tính thuế và khấu trừ VAT ngay tại khâu thông quan.
Thông tư 29 được đánh giá là bước tiến trong hiện đại hóa công tác thuế, giúp giảm thủ tục hành chính, tối ưu hóa nguồn lực quản lý và tăng hiệu quả thu ngân sách trong bối cảnh thương mại điện tử xuyên biên giới đang bùng nổ.
heo báo cáo của Cục Thuế, trong 6 tháng đầu năm 2025, các tổ chức và cá nhân kinh doanh trên các nền tảng thương mại điện tử và kênh online đã nộp khoảng 98.000 tỷ đồng tiền thuế, tăng 58% so với cùng kỳ năm 2024. Đây được xem là một trong những khu vực có tốc độ tăng trưởng nguồn thu nhanh nhất, nhưng cũng tiềm ẩn nhiều rủi ro thất thu nếu không có công cụ quản lý hiệu quả.
Giới chuyên gia nhận định, việc siết chặt chính sách thuế đối với hàng hóa giá trị nhỏ không chỉ giúp đảm bảo công bằng thuế giữa các kênh phân phối truyền thống và thương mại điện tử, mà còn là bước đi cần thiết trong bối cảnh Việt Nam đang hướng tới quản trị tài chính số và nền kinh tế số minh bạch, bền vững.